NetCDF 4.x 在 Linux 环境下的无根权限安装指南

NetCDF（Network Common Data Form）是一种广泛使用的科学数据存储格式，支持创建、访问和共享多维数组形式的数据。NetCDF 4.x 版本引入了许多新特性，包括对 HDF5 格式的支持，使得它可以处理更大的数据集，并利用更先进的数据压缩技术。

准备工作

在开始之前，请确保您的系统上已经安装了必要的开发工具和依赖项。对于 Linux 环境，通常需要以下工具：

• GNU make
• Perl
• zlib 库

如果这些工具尚未安装，您可以使用包管理器来安装这些工具，例如在 Debian 或 Ubuntu 上可以使用如下命令：

sudo apt-get update
sudo apt-get install build-essential gmake perl zlib1g-dev

步骤一：下载 NetCDF 源码

访问 NetCDF 官方网站或其他可信来源下载最新的 NetCDF 源代码包。请确保下载的是适合您需求的版本，并且支持 HDF5 和 zlib 压缩等功能。

官方网站地址是：http://www.unidata.ucar.edu/software/netcdf/

步骤二：准备编译环境

由于我们没有 root 权限，因此需要创建一个用户级别的安装目录。这里假设您将使用 ~/local 作为安装目录：

mkdir -p ~/local
export PATH=~/local/bin:$PATH
export LD_LIBRARY_PATH=~/local/lib:$LD_LIBRARY_PATH

步骤三：编译 NetCDF

解压 NetCDF 源码包，并进入解压后的目录：

tar xvf netcdf-*.tar.gz
cd netcdf-*/

如果配置脚本不支持 --with-zlib 选项，您可以直接通过环境变量来传递 zlib 的位置信息，而不是在 ./configure 命令行中指定。假设您已经根据之前的步骤设置了正确的环境变量，接下来配置编译选项：

./configure --prefix=~/local --enable-netcdf-4

这里的 --enable-netcdf-4 选项是为了启用 HDF5 支持。配置完成后，开始编译：

make

编译成功后，可以进行安装：

make install

步骤四：测试安装

安装完成后，可以通过编写一个简单的程序并链接到 NetCDF 库来测试安装是否成功。创建一个简单的 C 程序，如 testnc.c，内容为：

#include <netcdf.h>
#include <stdio.h>

int main(void) {
    printf("NetCDF library version %s\n", nc__version);
    return 0;
}

然后使用编译器编译它：

pgcc -I ~/local/include -L ~/local/lib -lnetcdf testnc.c -o testnc

如果一切顺利，您应该能够运行 testnc 程序，并输出 NetCDF 库的版本信息，表明安装成功。